Но инфекция может поразить еще и другим, более коварным путем — изнутри. Многим таким пациентам угрожает активизация латентной, или скрытой, инфекции: некоторые болезнетворные вирусы после проникновения в здоровый организм неспособны сразу размножиться, чтобы вызвать обычный, интенсивный ход болезни; они «затаиваются», ожидая подходящего момента. Защитные механизмы человека останавливают развившуюся было инфекцию. Но вирус еще не уничтожен. Возникает положение, сходное с «позиционной войной», когда два фронта находятся друг против друга в ожидании сражения. Вирус в зараженных клетках жив, но не активен. Его активизации препятствуют защитные силы организма. И если эти силы в период подготовки больного к трансплантации будут искусственно ослаблены, инфекция может бурно и беспрепятственно вспыхнуть. При «блокированной» таким образом болезни могут появиться совсем другие, неожиданные симптомы, а не те, которых можно было бы ожидать. Явления, связанные с активизацией латентной инфекции, натолкнули вирусологов на новые соображения и перспективы. Перед вирусологией, уже вооруженной опытом экспериментальных инфекций и познаниями из смежных медицинских областей (иммунологии, эпидемиологии, неврологии и др.) стоит задача вскрыть роль вирусной инфекции в происхождении тяжелых, продолжительных и неизлечимых болезней, в частности заболеваний нервной системы.
Долголетние клинические наблюдения над этими болезнями привели к вполне обоснованному выводу об участии вирусов в их происхождении. Роль вирусов может быть не только прямой, когда болезненные симптомы являются непосредственным результатом повреждения ими клеток, но и косвенной, когда вирусы вызывают нарушения, возбуждающие активность других механизмов, что влечет за собой характерное болезненное состояние.