На «экране» электронного микроскопа возникает изображение, как бы нарисованное пучками электронных лучей. Их путь изменяется в зависимости от плотности стоящего на их пути исследуемого объекта.
Электронные лучи, излучаемые катодом микроскопа, проходят в безвоздушном пространстве в сторону анода. Их пучок мы «заостряем» и направляем к нужной нам цели при помощи электромагнитных полей, исполняющих в данном случае функцию стеклянных линз оптического микроскопа. На «экране» микроскопа, или на фотопленке, возникает изображение предмета, полностью соответствующее характеру наблюдаемого объекта. Естественно, перед электронной микроскопией объект наблюдения соответствующим образом подготавливается.
Для получения изображения вирусов существует много различных методов, и все они прошли свои этапы развития. Чтобы обнаружить вирионы в клетках, в настоящее, время пользуются методом ультратонких срезов. Фиксированный материал, залитый эпоксидной смолой, разрезается тончайшим стеклянным или алмазным ножом. При помощи точных ультрамикротомов одну клетку можно разрезать более чем на тысячу тонких срезов. Полученные таким образом срезы обрабатываются затем специальными химикалиями, что обеспечивает лучшую их видимость (например, уранилацетатом).